政府军援军 21000余人在山县有朋的率领下进抵熊本。野津道贯随即召开军事会议，决定继续强攻熊本。会中将熊本战区重新分配，野津道贯军负责熊本西、北、南三面，以南面为主；山县有朋军负责东面，并阻止长崎方向前来的萨摩军援军。
25日至28日，桐野利秋亲率所部轮番与日本政府军大战，政府军不敌，伤亡惨重，被迫后退，桐野利秋一度收复了东门。同时，野村忍介亦率军击退进攻北门的政府军，并一度夺回外围的阵地。萨摩军前锋河野主一郎所部在艳坂与政府军苦战，连续八昼夜，彼此伤亡均极为惨重。后路村田新八率炮兵四面游击，增援各部，对政府军杀伤甚重。桐野利秋和林逸青分派各军在巷隘严防。此时虽然经过连日激战，熊本守军伤亡很大，但士气仍然高涨。
但此时，在野津道贯的一再申请下，又有14000人的政府军（随带火炮69门）进抵熊本，这时进抵熊本城下的政府军总数已经接近了80000人。29日拂晓，政府军于光明寺南路修筑炮台，三面猛攻萨摩军阵地。次日，又以巨型臼炮再攻，萨摩军以75毫米炮12门，120毫米炮6门还击，双方炮战正酣之际，林逸青率奇兵队300人趁机冲入政府军炮兵阵地，击毙政府军511人，炸毁重炮3门。山县有朋得知林逸青现身，立刻命令山川浩大佐率拔刀队前去截杀林逸青，但山川浩到达时，林逸青已然率部下退走，只留下一地的死尸和毁坏的火炮。
10月1日，政府军援军12000人重新发动进攻，并在城门外架炮向城内轰击。林逸青再次亲自率兵夜袭。政府军撤退。第二天。山县有朋不顾伤亡又一次发动进攻。又被击退。
10月3日，政府军兵分三路大举进攻，筱原国干亲至阵前督战，政府军集中炮火猛轰，萨摩军炮兵因连日激战，弹药不足，炮火很快被政府军压制，阵线动摇。筱原国干身着黑色军服，披红披风，手执战刀，骑于马上，往来奔驰指挥，山川浩认出了筱原国干，通知了山县有朋，山县有朋下令向筱原国干所在的方向射击，政府军枪炮齐射，一时间弹如雨下。筱原国干身中三弹，犹奋力砍杀敌兵。死战不退，左右劝其暂避，筱原国干言曰：“此致命遂志之日也，虽及死不得退此一步。“，未几，乱枪射来，筱原国干，遍体鳞伤，衣袍尽赤，犹奋臂指挥督战，最后飞弹洞胸，坠于马下，殁于阵中。同时殉难者尚有越山休藏、松谷英孝等武士首领。不过萨摩军并未因丧为实际前敌指挥的筱原国干而受挫败，依然奋勇冲杀，取得了此次战役的胜利。亲历此战役，作为萨摩军同盟的熊本武士首领池边吉十郎有诗：“君不见熊本之险险于城，突兀摩空路峥嵘。烟笼高濑川边水，风卷三岳峰上旌。一朝传警笑相待，忽闻千军万马声。硝烟为云弹为雨，壮士一命鸿毛轻。呐喊声和巨炮响，山叫谷吼乾坤轰，炮声绝处松声寂，一轮皎月照阵营。” 就是这次激战的真实写照。
筱原国干的尸体被送回西乡隆盛所在的参谋本营时，依然裹着如血一样殷红的斗篷。西乡隆盛看到筱原国干的尸体，悲伤难禁，失声痛哭。志在“征伐四方” 的筱原国干终战殁于故乡的土地上，而更多如筱原国干一样的交战双方的日本武士们，还要继续担戈披甲，在弹雨纷飞、炮石交坠的战场上为日本武士最后的荣光奋战争先。
从10月2日至4日，交战双方几乎每天都组织数千人规模的进攻，战斗相当激烈，在日本政府军的猛烈进攻下，萨摩军因兵力军火不足，渐渐处于下风。10月5日那天，政府军第五次猛攻北门，将北门攻破。在东门，政府军于10月5日晚以死囚组成的敢死队数百人为前驱，踩爆萨摩军埋设的地雷，一度冲进了东门。守军奋力抵抗，内城的居民也利用暗夜打冷枪、发射火箭、以刀剑砍杀敌兵，积极配合萨摩军打击敌人，但到天明时，东
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