二原先的历史上，三省六部制是西汉以后长期展形成；正式确立。唐朝才进一步完善。
三省为中书省、门下省和尚书省。中书省乃是决策机构，负责草拟和颁皇帝的昭令。最高长官是中书令。官品是正二品，下面还设有正三品的侍郎两名，相当于中书令的副手。门下省则是审议机构，负责审核政令，也就是审核中书省和皇帝决策的政令，看看有没有不合理的地方。通过才能够执行，否则得驳回。最高长官是侍中，也称纳言，同样是正二品，之下也有两位正三品副手侍郎。
至于尚书省，乃是执行机构。
负责执行由中书、门下决策审核过的政令。
从中书、门下出的诏令制敕，均经由尚书省转到中央各部门及地方各州县，或者根据诏令制敕的精神制成政令，下达到有关部门。
所谓的吏、户、礼、兵、刑、工六部就是尚书省的执行机构部门。
因此尚书省是执行机构。
职责很重要，因此除了最高长官是尚书令。
正二品外。
之下的副官左右仆射要比中书门下的副官级别高一点，是从二品。
在左右仆射之下。
还有正四品的副长左右承。
对于中书、门下和尚书三省，李玄霸经过仔细的考虑之后。决定维持不变，三省的最高长官。也就是宰相之职，李玄霸让跟随他最久，功劳和能力也最高的杜如晦小道士李淳风和虬髯客张仲坚三人担任。杜如晦是中士和侍中，而虬髯客是尚书令。
李玄霸出于对杜如晦的信任目的，或是说为了能让自己清闲一点，不至于像前世看的影视剧的皇帝一样，每天要处理堆积如山的奏折。忙得连睡觉的时间都没有，即给了中书省自行决策和处理地方奏折的权力。
中书省有了这样的权力，性质基本上就跟大明朝中后期的内阁差不多了。
李玄霸深信只要军权牢牢的掌握在自己的手中，就不怕权力旁落。
反正以他的威望，想需要什么或决定要做什么还不是一句话的事情。
他能给杜如晦等人权力，也照样能收回。
因此李玄霸希望自己的江让永固。
百姓安居乐业的同时。
自己也不用辛苦。
刻好像中晚期的大明朝一样，哪怕是皇帝二十多年都不上朝理政。
国家机器也能依靠一班大臣和一整套政务流程维持正常运转，啥问题也没出现。
总之，这种制度乃是人尽其才，利用集体智慧，防止个人专断而引严重错误导致江山送葬的有效措施。
反之。
换成像崇祯这样的“勤政。
皇帝，全国大大小小的事情都自己处理，结果送葬了大明朝。
给了杜如晦担任中书省最高长官中书令外，李玄霸还给他安排了两位副官。也就是正三品的中书侍郎，一个是被徐世劫送来的虞世南。另一个则是被罗艺派来代表温彦博。
这个温彦博也是个大才。在原先历史上就是劝罗艺投唐，后来也进入了中书省，受到重用，甚至还当上了中书令，成为唐初名气不下于房玄龄、王佳、魏征等人的辅政宰相之一。而且他的兄弟温大雅和温大有也都是相才，目前正在长安辅助他的便宜父亲。因此，当李玄霸知道罗艺派来向他献投诚书的代表是温彦博后。欣喜之下立即就将他留在了洛阳。
除了虞世南和温彦博，李玄霸还同意了杜如晦的提议，将许敬宗、苏世长、张亮、韦挺等人也安置入中书省。封为中书舍人。许敬宗和张亮是原瓦岗军的谋士，苏世长和韦挺则是原洛阳官员，都是人才。这样一来。中书省算是人才济济了。
而门下省除了最高长官小道士李淳风外。
也安置了两个人才做小道士的副官，即正三品的门下侍郎，一个是杨恭仁，此人也是被徐世劫在取回传国玉垒时一起带回来的，原在宇文化为的麾下做官。
据杜如晦等人调查，杨恭仁此人不但有才能，而且洁身自好，在江都时就一直受到贪官污吏排挤，却从不肯与其同流合污。
因此杜如晦等人才提议让杨恭仁进门下省。
至于另一个门下侍郎。
却是王世充的儿子王玄恕。
这个，王玄恕在王世充死后一直留在洛阳城，他跟他父亲王世充是完全不同的两个人，为人正直，也洁身自好。
杜如晦和小道士考核过他后对很赞赏，因此李玄霸才不计较其身份，同意让他进入门下省。
至于尚书省，除了让虬髯客担任最高长官尚书令外，从二品的左右仆射分别由李玄霸的叔父李神通和一个叫戴胄的原洛阳官员担任。
尽管李玄霸不觉得李神通之才能够担任左仆射，不过让他继续领军作战李玄霸更不放心，因此才把他安排到中书省。李玄霸很清楚虬髯客的能耐和心机的，他是绝对能够压制住李神通的，不会让李神通在尚书省目高于顶、无法无天或是胡来而坏了政事。
除了这三省机构外，原尚书省下的吏、户、礼、兵、刑和工等六部执行部门被李玄霸改成了十四部。
分别是：人事部，此部与原史部性质相同，专门负责全国四品以下的文职官吏的任免、考课、升降、调动、封勋等事务。
因为一直没想到好人选。
其最高长官部长暂时由杜如晦和虬髯客共同兼顾。
财政部，其性质跟原户部相同，不过被李玄霸从中分出了国税部和民政部，三个，部门共同负责原户部所负责的事务。
财政部管财库、货币、官员俸禄和财产收支的情况，其部长李玄霸让给了马三宝担任。
国税部则不用说，专门负责税收制度，由原瓦岗谋士，徐世劫麾下的人才郭孝博担任。
至于民政部。
则负责的是土地、户籍以及婚姻等事务，其部长叫杜淹，此人却是杜如晦的叔叔。
一直都在洛阳在官。
原先的礼部则被李玄霸细分出了四个部门，其一是教育部。
专门负教育和学校的事务，其部长是李玄霸早已经任命了的大儒孔颖达。
其二是文化部。
部长乃是大书法家欧阳询。
不过李玄霸因为深感这个时代的娱乐太少，人们的精神空虚，因此比较看重这文化部，在文化部下面还细分出七个，，二真礼院、音乐院、舞蹈院、戏剧院、棋院、书画院和侧肖四了除了专门负责礼仪和祭典的典礼院请了一个名气不下于孔颖达的名儒陆德明担任外。
音乐院、舞蹈院、戏剧院、棋院、书画院和体育院李玄霸都请的女人担任。
